Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI5

NMRK2, Nicotinamide riboside kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK2Q9NPI5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMRK2Q9NPI5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMRK2Q9NPI5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms