Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0A8

COMMD4, COMM domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4Q9H0A8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COMMD4Q9H0A8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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