Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF3Q9H094 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms