Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLIRPQ9GZT3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms