Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms