Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms