Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4CQ9C0C4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms