Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP4Q9C0A0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP4Q9C0A0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms