Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms