Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
YTHDF1Q9BYJ9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms