Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF17Q9BXT8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms