Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R3Q9BXE9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms