Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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