Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFHD1Q9BUP0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms