Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RSG1Q9BU20 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms