Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS4Q9BT78 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms