Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GCNAQ96QF7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms