Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLIN4Q96Q06 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms