Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC7Q96M83 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC7Q96M83 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms