Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC41A2Q96JW4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms