Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCC12Q96J65 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms