Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms