Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms