Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UTP4Q969X6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms