Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BHMTQ93088 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHMTQ93088 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms