Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA6Q92908 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms