Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TOPBP1Q92547 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPBP1Q92547 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms