Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C15orf40Q8WUR7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C15orf40Q8WUR7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms