Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTP9

XAGE3, X antigen family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAGE3Q8WTP9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAGE3Q8WTP9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
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