Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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DTX3Q8N9I9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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DTX3Q8N9I9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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DTX3Q8N9I9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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DTX3Q8N9I9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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DTX3Q8N9I9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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DTX3Q8N9I9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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DTX3Q8N9I9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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