Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms