Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NME9Q86XW9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME9Q86XW9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms