Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HECW1Q76N89 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HECW1Q76N89 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms