Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEM1Q6ZVN7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEM1Q6ZVN7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms