Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
WDR88Q6ZMY6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms