Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCBE1Q6UXH8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms