Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD4Q5VX71 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms