Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCID2Q5JVF3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms