Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERC4Q5GLZ8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERC4Q5GLZ8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms