Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC93Q567U6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms