Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP28Q4G0W2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP28Q4G0W2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms