Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00303Q3SY05 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms