Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC57Q2TAC2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC57Q2TAC2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms