Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms