Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RRN3P1Q2M238 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms