Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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