Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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