Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DDR2Q16832 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DDR2Q16832 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms