Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PPP1R3AQ16821 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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