Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NTRK2Q16620 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NTRK2Q16620 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms